Punkaharjun kirkko eli Apostoli Tuomaan kirkko on Punkaharjun kappeliseurakunnan kirkko ja sijaitsee entisen Punkaharjun kunnan Punkasalmessa Savonlinnassa. Punkaharjun kirkko on vihitty käyttöön uudenvuodenpäivänä vuonna 1923. Kirkon on suunnitellut savonlinnalainen rakennusmestari R. Rouhe (Rosengren). Alttaritaulun kirkkoon lahjoitti And. Auvinen Osakeyhtiö. Alttaritaulun kuvaa apostoli Tuomasta ja sen on maalannut Martta Helminen 1927. Kirkon ensimmäiset urut valmisti Kangasalan urkutehdas Punkaharjun seurakunnan 10-vuotisjuhlaan. Nykyiset kirkon 15-äänikertaiset urut on vuodelta 1973 ja rakentanut urkurakentamo Hans Heinrich.